Elintarviketurvallisuusvirasto Eviran mukaan Suomessa eläinsuojeluviranomaisina toimivat Maa- ja metsätalousministeriö, Evira, Aluehallintovirasto, tarkastus-, raja- ja kunnaneläinlääkärit, kuntien terveystarkastajat sekä poliisi. Ylin eläinsuojeluviranomainen näistä on Maa- ja metsätalousministeriö, joka valvoo muun muassa eläinsuojelulain säännösten noudattamista ja täytäntöönpanoa.
Evira kertoo omilla sivuillaan valvovansa eläinsuojelulain, eläinkuljetuslain ja eläinkuljetusasetuksen sekä niiden nojalla annettujen säännösten täytäntöönpanoa ja noudattamista. Evira myös johtaa, kehittää ja ohjaa eläinsuojelu- ja eläinkuljetuslainsäädännön valvonnan toimeenpanotehtäviä.
Aluehallintovirasto puolestaan kertoo ohjaavansa kuntien eläinsuojeluvalvontaa ja valvovansa eläinsuojelulain ja –määräysten noudattamista. Lisäksi Aluehallintovirastolla on omia läänineläinlääkäreitä, jotka tekevät sekä omia että EU:n edellyttämiä eläinsuojelutarkastuksia. Aluehallintovirasto voi myös myöntää tämän tarkastusoikeuden eläinsuojeluvalvojalle, mikäli hän on osoittanut perehtyneensä tarkastuksen kohteena olevaan eläinlajiin ja on suorittanut hyväksytysti Eviran järjestämän eläinsuojeluvalvojakurssin. Eläinsuojeluvalvojalla ei kuitenkaan ole oikeutta suorittaa tarkastuksia kotirauhan piiriin kuuluvissa eläintenpitopaikoissa.
Eläinsuojelulain mukaan paikalliset viranomaiset, kuten kunnaneläinlääkärit ja poliisi, valvovat kuntien alueilla eläinsuojelulain noudattamista. Aluehallintoviraston mukaan epäilyilmoitus eläinsuojelulain vastaisesta eläimen kohtelusta tulee tehdä ensisijaisesti kunnaneläinlääkärille, mutta eläinsuojelulain mukaan kaltoinkohteluepäilyyn perustuva tarkastusoikeus on myös aluehallintovirastolla, kunnan terveystarkastajalla, poliisilla ja eläinsuojeluvalvojalla.